距菏澤僅80公里的嘉祥機場目前已開通了通向全國許多大中城市的航線。

菏澤地區交通便利，新兗石線在菏澤橫穿東西，新建成的京九線縱貫南北，四通八達的鐵路通往全國各地。菏澤火車站位於京九線和新臼線的交界處，南有亞歐大陸橋——隴海線，從這裏可直達北京、香港、歐洲大陸和日照港，並可到達全國各地。

以菏澤為中心的十多條公路幹線輻射全區通向全國各地。